FTP nedělá chroot, ale „překládá“ zadané adresáře na adresáře na serveru. Adresář, do kterého se chrootuje, může vlastnit kdokoliv, pokud vím, tak SSH to nijak neomezuje.
Kolize lze vyřešit tak, že se do /sftp vytvoří symlink „sftp“ ukazující na „.“. Nebo přes PAM lze pro SFTP a FTP nastavit rozdílné domovské adresáře.

