Nevím, jak si představujete implementaci postupného mizení bez reálné průhlednosti, kterou dodává právě Compiz, to prostě nejde, mizení je jednoduché stažení průhlednosti 0%->100% během krátkého časového úseku a následné zavření okna. A s nepravou průhledností á la gnome-terminal nebo panel, to už radši tak, jak to je.
Pokud jde o ty ovládací prvky, tak doporučuji shlédnout rozhovory se Shuttleworthem, jejich absence je cílový stav, tak to bylo plánováno a určitě se to do budoucna měnit nebude ... koncept je takový, že notifikace mají člověka pouze informovat, nikoli nabízet nebo vyžadovat nějakou interakci.
Pokud mám hovořit za sebe, 9.04 už provozuji od verze Alfa 3, bez Compizu a zezačátku mě to taky bilo do očí, ale rychle jsem si zvykl. Dokonce jsem si zapnul více notifikací, protože je teď nemusím odklikávat, když překážejí. Třeba si taky rychle zvyknete ;-)

