Stejně tak ve Windows existuje regedit a dokumentace.
To je stejně nesmyslná otázka, jako se ptát "kam zapisuje hodnoty GUI". Group policy GUO pracuje s templates. MS dodává nějaké templates, které ovlivňují konkrétní hodnoty v Registry, a to je samozřejmě popsané. Ovšem templates si můžete vytvořit sám.
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms815238.aspx

