Domnívám se, že hlavním důvodem je, že porce (vlastních, či jinak získaných) znalostí nutná k nainstalování a konfiguraci linux aplikace (kterou dostávám většinou zdarma) je neúměrně větší než porce znalostí nutných k obstarání/instalaci/konfiguraci analogické aplikace pod Win32/64.
Z čistě ekonomického pohledu se uživatel přikloní k win alternativě, protože ji obstará a možná i provozuje s nižšími naklady. Pokud však společnost potlačí/vymýtí krádeže sw, pak stejní uživatelé budou svými peněženkami ovlivňováni odlišně.
Dalším důvodem malého rozšíření je nedostatek lokalizované dokumentace k aplikacím, případně jejich aktualizace v čase.