Vyšla nová verze verzovacího systému Monotone 0.99.1, která následovala hned dva dny po vydání 0.99 a to z toho důvodu, že během posledních minut před vydáním byla do verze 0.99 zanesena chyba, která znemožňovala funkci na 64bit systémech. S verzí 0.99 přišlo několik zásadních novinek, jako přepracování selectorů, URI, uživatelského rozhraní, bylo přidáno automatické generování manuálových stránek a mnoho dalšího.