To není ani trochu pravda. Systemd (jak je též zmíněno v odkazovaném článku) nemá s odděleným /usr vůbec žádný problém. Jen tak nějak z dobré vůle vyhazuje varování, aby si uživatel důkladně popřemýšlel, jestli ten oddělený /usr potřebuje (pokud ano, může varování vesele ignorovat).
Bohužel totiž ostatní komponenty systému (zejména udev) v nepřítomnosti /usr tiše vybuchnou a uživatel na to přijde, až když řeší, proč mu netiskne tiskárna či neakceleruje grafika (kvůli špatným ACL na /dev/ souborech).