Ad 1. Myslím, že na vaší úvaze něco je. Kolegové, kteří algoritmus hodnocení tvořili, měli nepochybně dobrý důvod pro odlišný přístup, ovšem jaký důvod to byl, to vám teď nepovím. :-) Až se bude nová verze připravovat, určitě se nad tím zamyslíme.
Ad 2. I tohle je věc k hlubšímu zamyšlení, ale myslím si, že by to nepřineslo žádné velké zlepšení; spíše by to mohlo vést ke snaze o zneužití (vytváření mnoho duplicitních identit pro jednu osobu apod.).
Ad 4. a 5. Přemýšlíme o tom, že bychom na výpisu diskusí použili "javascriptové rozbalování". Pokud byste si nechal zobrazit jen kvalitní či jen nové názory, natáhla by se vám stránka s úplným výpisem názorů; kompletně zobrazené by však byly jen ty, které vyhovují vaší podmínce (tj. chování jako nyní). Kdybyste se chtěl podívat i na nějaký jiný názor v threadu, stačilo by kliknout na nějaké "plus" či jiný prvek a rovnou ve stránce (bez reloadu) by se vám rozbalil.
Zatím není jisté, zda touto cestou půjdeme, protože má i svá problematická místa, ale z uživatelského pohledu se mi zdá, že by to bylo šikovné řešení.