Jak se mohlo kódování projevit při překopírování do Libreoffice tedy nechápu, ale na 99% je to problém mezi klávesnicí a židlí (resp. ještě jinak: kdyby náš dokumentační tým řešil takové s prominutím kraviny, tak by si nevydělal ani na slanou vodu :-) a to komunikují s celým světem a taky přebírají různé formáty s výstupem do DocBooku (TeX je již z principu slepá ulička, takže ten je jen součástí toolchainu úplně na konci).
A ano, UTF-8 je transformation format, pokud někdo potřebuje (skutečně potřebuje?) práci s jednotlivými znaky, je zde UCS, pořád ale výhody převažují nad touto relativně malou nevýhodou, která je navíc řešena knihovnami.