API Windows se prakticky nemění. Pokud aplikace přestane fungovat s přechodem na novou verzi Windows, nejspíš ji autoři zprasili. Bohužel to není neobvyklé.
Problém je už v tom, že nemůžete použít jeden balíček na všech x64 distribucích. Máte balíček pro RHEL, jiný pro Ubuntu, další pro Mandrivu... A samozřejmě pro každou verzi distra jiný.