Největší problémy asi vznikají, když se importuje již zalámaný dokument z Wordu nebo vyexportovaný z jiného textového editoru. ID ho zobrazí správně, ale někde v pozadí asi zůstanou formátovací příkazy a ty dělají problémy. U obrázků je to záležitost toho, jakým způsobem byly umístěny do textu (plovoucí, pevné). Nejlepší výsledek je při importu čistého textu a veškeré úpravy dělat jen v ID.
Se zásadně špatnou strukturou textu jsem se ale nesetkal. Asi záleží na složitosti textu a zároveň provádíme závěrečnou úpravu právě v SIGILu. Ten pak možná některé problémy automaticky odstraní. Například v jedné starší verzi ID nebyly v e-pub po exportu adresáře a po přeuložení v SIGILu bylo již vše v pořádku.