Když po aktualizaci máte v paměti (podle příspěvcích o uptimech nejméně pár let :)) děrvaý či jinak závadný kód, tak to opravdu není dobré.
Faktem je, že ve Windows vyžaduje setup mnohdy restart bez důvodu ("pro jistotu"). Velká spousta visutací restart nevyžaduje. Další vyžadují vypnutí nějaké služby a její nahození. Jiné věci chtějí restart.
Mimochodem už umíte na Linuxu vyměnit driver video karty, a nechat běžet GUI aplikace (tedy bez shození X11 serveru)?