Inerciální navigace není nijak více náchylná na lidskou chybu než jiné navigace. Její problém je, že s časem uplynylým od nakalibrování ve výchozím bodě její přesnos postupně klesá a musí se ověřovat. Na dlouhých letech jsou to poměrně významné odchylky, nemluvě o moři.
Potvrzení validní pozice na moři může být bez GPS jak pro letadlo tak pro loď problém, nelze tam mít radionavigační majáky a hvězdy také nemusí být k vidění.
"Zbloudilých" letadel odchýlených od trasy bývalo hodně, naštěstí je běžně vojáci nesetřelovali (pomineme-li Sovětský Svaz), nicméně oblétávání uzavřeného SSSR sahajícího daleko do polárních oblastí blízko k magnetickému pólu bývalo hodně nepříjemné a navigačně ošemetné.