5 cert / týden platí pouze pro duplicitní certifikáty nikoliv pro certifikáty na různé domény třetího řádu. Tam je limit 20 za týden.
Počítat u nějakého hostingu, že budou dávat 100 uživatelským webům stejný certifikát... no to snad ne!
Nemyslím, že by Public Suffix List sloužil pro tento účel.
To co zmiňujete, má jednoduché řešení. Let’s Encrypt má na stránkách formulář, kam obdobní poskytovatelé, stejně jako velké firmy či organizace vyplní žádost, že potřebuji vyšší limit a po pár týdnech je vyřešeno.