Něco podobného jsem řešil včera s PhpStorm. Tak najde něco v projektu a okamžitě něco nastaví/přenastaví a pak, když Vám to díky tomu includuje jeden package (~dependecy) dvakrát, tak Vám při autocomplete začne tvrdit, že nic takového nezná místo toho, aby laskavě milostivě oznámil, že to tam někde vidí dvakrát, takže zdržení hodinu a hledání co kde se nasatavilo a s čím to koliduje. Bombastické. Děkuji teamu že někdo pořád ví, co je pro mě dobré.