Nevymýšlejte si. Registry se nijak nerozjebává. Nejvýš tam mohou aplikace něco zapsat, úplně stejně jako v případě konfiguráků.
Linux samozřejmě neumí patchování za chodu. Soubor na FS sice můžete nahradit, ale kopie běžící v paměti tím nenahradíte a jsou nezáplatované. Navíc se vystavujete riziku, že vám kombinace nového a starého kódu udělá z dat řezanku. Například běžící starý executable může natáhnout novou knihovnu, a nadělat paseku. Předpokládám že jste ani nad jedním z těch aspektů nikdy nepřemýšlel.
Popsaný DoS přes RDP byl opravený tuším v roce 2005, je to KB 899591.