NTS byl navržen právě tak, aby ten vliv byl minimalní. Ono se tam skoro nic nešifruje. NTP pakety se autentizují pomoci AEAD (např. AES-SIV-CMAC). Na CPU s HW podporou AES to trvá pár mikrosekund. Pokud je potřeba větší přesnost, tak NTP má "prokládaný" režim, kde je to úplně jedno jak dlouho to trvá.