Možná by vám to rychleji bootovalo do Windows ;)
Na Linuxu bylo ještě před pár lety běžné, že když aplikace nějakou dobu stojí, přepnutí na ní trvá celkem dlouho. Pořád to tak je?
Pokud se vám systém po nějaké době "zaseká" a zpomalí, má nějaká z aplikací resource leak. Pomůže tu aplikaci zavřít (hint: třeba Firefox je notoricky známý svými resource leaky). Monitorovat systémové zdroje s Performance Monitorem snad zvládnete.