Proteiny se skládají z aminokyselin v pořadí zakódovaném v DNA. Díky sekvenování DNA známe dědičnou informaci mnoha organismů a tím pádem i proteinů, které produkují. Problém je v ve velmi složitém 3D poskládání proteinu, který má velký vliv na výsledné vlastnosti. Připomeňme například přes dvacet let starý a stále běžící distribuovaný projekt Folding@Home.
DeepMind patřící Google pracuje již nějakou dobu na skládání proteinů pomocí umělé inteligence. Projekt se nazývá AlphaFold a tento měsíc zveřejnil otevřenou databázi s více jak 200 milióny složených proteinů 20 organizmů, včetně prakticky všech 20 tisíc lidských proteinů. Navíc je barevně znázorněno, s jakou jistotou je daná část poskládaná. Modrá označuje velkou jistotu a červená velmi malou. Inferenční (dotazovací) část AlphaFold je open source pod licencí Apache 2.0 a zdrojové kódy v Pythonu najdete na GitHubu.
(zdroj: slashdot)
