Technicky (IMHO) v nicem. Rozdil je hlavne v licenci, viz http://en.wikipedia.org/wiki/OpenJDK.
Jeste bych to upresnil. OpenJDK vznikl opensourcovanim vetsi casti zdropjaku Java6. Sun uvolnil vse co mohl. Bohuzel nektere casti pro nej napsaly treti strany a nebylo je mozne otevrit. Proto napriklad v OpenJDK nefunguje poradne webstart.
Pro webstart je pouzity opensource projekt a ne originalni Java.