Jednou z nevýhod Flatpaku je, že jak jsou aplikace sandboxované, tak nepřebírají vzhled prostředí. To nově můžete částečně vyřešit instalací témat vzhledu GNOME přímo ve Flatpaku, kde fungují jako rozšíření pro GNOME runtime. Není tak třeba mít pro každou aplikaci specifickou verzi vzhledu.
Tímto způsobem je k dispozici několik nejrozšířenějších vzhledů, které můžete nainstalovat z repozitáře Flathub. Jedinou podmínkou je mít Flatpak 0.8.4 nebo novější a GNOME runtime alespoň ve verzi 3.24.
