Hlavní rozdíl a přínos Let's encrypt má být právě v tom, že zatímco u StartSSL se k verifikaci používá spojení člověk - web interface, tady to bude let's encrypt klient s let's encrypt serverem, takže to bude mnohem snazší.
A taky má být revokace zadarmo, takže se připravte na terrabajtové revokační seznamy. Ale co na tom, stejně je většina nekontroluje. :)
Osobně jsem trochu skeptický. Nevím, kde taková autorita sežene peníze na potřebné audity, aby mohla být zařazena mezi důvěryhodné.