A nemělo by to být spíš závislé na architektuře a platformě? Na některých CPU je LZ4 z hlediska rychlosti efektivnější, než na jiných; na strojích, kde je pomalé IO (např. Raspberry) je asi lepší mít sice pomalejší algoritmus, za to ale znatelně menší soubor, apod. Kromě toho nevím, jestli každý bootloader a priori podporuje LZ4, takže minimálně na některých platformách se asi stejně bude muset dál používat starý gzip.
Dekompresi initramfs si zařizuje kernel sám (konkrétně tady).