V podstate sa da pouzit lubovolny spravca okien, ja pouzivam fvwm (ten standartny twm bol pre mna az prilis "masochisticky", a kde/gnome ma dost vysoke naroky na cpu/pamat). Pokial ide o nahradu exploreru, tu sa skor prihovaram za nainstalovanie nativnej verzie mozilla/firefox-u pre win. Ak by sa aj dali skompilovat pre cygwin, asi by boli o dost pomalsie...
Určitě doporučuji používat nativní aplikace, pokud není důvod pro opačnou verzi. Správce oken používám interní a mohu na desktopu mixovat okna cygwinu/vzdálených X aplikací/nativní windows okna.
Bohužel, libovolný WM v X běží jako nezávislý proces o náhradu, ani doplnění Windows Exploreru se v žádném případě nejedná...
O které vlastnosti Vám jde? Možná existuje jiné řešení/doplnění Windows Exploreru, např. na virtuální plochy a klávesové zkratky existuje podle mého názoru dost uspokojivých řešení (sám několik používám :-).
No, ono kazdy z tych cygwin-win manazerov (twm, fvwm, kde,...) sa da spustit ako "rootless" (bezi na pozadi, okna sa potom vo Win daju lubovolne mixovat a neni velky rozdiel medzi win-oknami, cygwin a remote X) ale aj ako root-window (potom sa spusti 1 velke okno samotneho window managera obvykle velkosti rozlisenia monitora a vsetky dalsie cygwin/X okna su umiestnene "v nom" a spolu s nim sa daju posunut a minimalizovat). Osobne pouzivam prave tuto druhu moznost, vyhovuje mi ze vsetko co patri cygwin a remote session mam pokope...