Osobne pouzivam gui program dvd::rip (http://www.exit1.org/dvdrip/) - rozhrani pro transcode. Umoznuje velmi pohodlne vizualni orezavani videa (idealni pro cerne okraje filmu), vsechno je velmi intuitivni a hlavne ma cluster mode, ve kterem lze video encodovat na vice strojich bezicich v siti.
Je to velmi prijemne kdyz mi doma desktop a notebook encoduji spolecne na 80fps :)
No..ja pouzivam GUI Acidrip, coz je primo nadstavba nad MEncoder a jsem hodne spokojenej.
Oficialni stranka je ted sice nedostupna http://acidrip.sf.net ale da se stahnout treba tady http://www.icewalkers.com/Linux/Software/518370/AcidRip.html nebo treba na http://www.linuxsoft.cz. Je to napsany v perlu nad GTK.