Je celá řada možností. Dneska slušnější výrobci takovýchto karet mají i ovladače pro linux. Pak existuje celá řada ovladačů samostatně. Ja používám knihovnu comedi, protože to podporuje s jednotným ovládáním přes 200 různých karet a jde to použít i v real-time prostředích, tak i normálně v user space, dokonce i tuším z perlu.
http://stm.lbl.gov/comedi/
