Z vlastní zkušenosti vím, že při dobře vylazeném konfigu - zkompilované jádro, q3.cfg ... (ani to možná není potřeba) určitě Q3 _není_ pomalejší, co se týče výkonu - rámů za vteřinu (FPS), než ve Windoze :)
Například když mám 125-130 FPS na timedemo ve Windoze, v Linuxu je to 140-145.
A linuxových on-line sportovců to může potvrdit .)