Určitě. Nicméně pro arduino už jsou knihovny hotové, odladěné, práce na chvíli.
Nebo rovnou hotový modul komunikující přes sériový port za 50 Kč http://www.ebay.com/itm/5V-IR-Infrared-Remote-Decoder-Encoding-Transmitter-Receiver-Wireless-Module-D/112042503821