osobně si myslím, že to začalo tím, že chtěli být "dynamičtější" .. někomu nevonělo, že byl tak dlouhý čas mezi vydáním další stabilní verze.. být "cutting edge" mi u debianu nesedí.. ale dneska je jiná doba. Přijde mi to často jako revoluce pro revoluci. Místo "starého a dobrého" samé "novinky" :) Ale každý má jiné preference a tohle je jen takový "postesk". Nejsem žádný linux guru ani super user, a je možné, že prosazené změny opravdu pomáhají té skupině, která je prosadila..
O „horkou novinku“ skutečně nejde – jak zmiňujete, i tady byla průkopníkem Fedora, a to v roce 2012 s verzí 17. Brzy následoval Arch a jiné distribuce, Debian se teď tedy snaží přijmout již dobře vyzkoušenou a fungující změnu.
Sloučení /usr je každopádně ještě starší nápad: první s ním údajně přišel Solaris verze 11 v roce 2010. V rámci Linuxu jde tedy i o snahu udržovat kompatibilitu se Solarisem a dalšími Unixy, které to mají podobně.
Kromě toho má mít sloučené /usr a tím pádem zjednodušené rozvržení souborového systému ještě další výhody, které rozebírají zde v tomto článku, například jasné rozlišení distribucí dodávané části OS od uživatelské nebo možnost tuto dobře vymezenou distribuční část exportovat přes síť.
Historický důvod byl ten, že Thompsonovi a Ritchiemu jednoho dne došlo místo na disku a tak koupili ještě jeden a namontovali ho do /usr. Unixáci od té doby k téhle struktuře mají přímo religiózní vztah, ale její pravý původ je takhle prozaický. Můžeme mluvit o štěstí, že ten druhý disk se nenaplnil příliš rychle, jinak jsme měli ještě /usr2 (nebo /usr/usr ?)
Asi to bude tím, že diskety nebyly tak veliké, aby se vše vešlo na jednu. Proto se asi /bin dal na jednu, na další třeba /usr/bin atd.: http://askubuntu.com/questions/130186/what-is-the-rationale-for-the-usr-directory
Že je to irelevantní tvrdí i Landley: http://www.osnews.com/story/25556/Understanding_the_bin_sbin_usr_bin_usr_sbin_Split
Jinak je ale těžko říct, proč zrovna /bin by měl jít do /usr/bin a ne /usr/bin do /bin. Vcelku je to jedno, pokud bude vše v cestě (PATH), tak to asi je celkem šumák.
Na druhou stranu, jednou jsem si hrál s chroot a omylem jsem si smazal skutečnou složku /bin. Ještě že jsem měl nástroje z /usr/bin a mohl si binárky dotáhnout z jiného systému s Debianem. (http://superuser.com/questions/657959/accidentally-deleted-my-bin-folder/922015#922015)
To by za určitých okolností byl argument...