cs_CZ je čeština (cs) v České republice (CZ), tj. žádný problém
nevidím. Jazyk se zkratkou cz pravděpodobně neexistuje.
U Slováků je opět také správně jazyk slovenčina (sk) na Slovensku
(SK) (že jsou oba kódy stejné, je spíše výjimkou).
Možná je to „cs“ podle CeStina. :o) Ty ISO 639-1 kódy jsou často tvořené podle původního názvu jazyka, a ne podle anglického, např. DEutsch, ESpañol, HRvatski, apod. A v návrhu standardu ISO 639-3 má čeština kód „ces“.
Ano, je to evidentně z CeStiny. ISO 639 evidentně dává přednost
původnímu jazyku, nebrání-li tomu nezvyklý grafém nebo
jiz obsazená zkratka, viz slovenština (sk, kde sl již bylo
obsazeno).