Tenkrát (kolem roku 2000) jakákoliv úprava FAT32 oddílu znamenala aktualizaci dat (na konci disku) a metadat (FAT tabulka je na začátku disku), což znamenalo téměř plný přesun hlaviček nad plotnami, což vedlo k dramatickému propadu rychlosti čtení/zápisu. Protože track-to-track byl 1ms, zatímco average 15ms, byl full seek kolem 30ms, což znamená 30násobné zpomalení čtení/zápisu (tenhle problém u flash pamětí neexistuje, u disku byl/je kvůli tomu propad i u sekvenčního čtení/zápisu). Dlouhá jména problém nejsou (je v podstatě jedno, jak je to uloženo), velikost souborů nad 2GB (resp. 4GB) je problém jen pro někoho (já je nepoužívám vůbec).