Jak v čem. Hodně overheadu zmizelo, výrazně se optimalizovalo, C struktury se líp zarovnaly, ale proti tomu např. přechod z hardwarových integerů na softwarové BigInty výrazně zpomalil aritmetiku, takže různé bitwise operace, kryptografie atd. zpomalily na polovinu (což je OK protože pure python implementace tohoto nikdo nepoužívá).
Myslím že to "if Python is too slow for you you're using it wrong" platí dál. Chápu to jako runtime kterým interaguju s uživatelem, natahám si data, naparsuju XML a JSONě, ale na samotné zpracování to pošlu do nativního modulu.