S příchodem projektu Let's Encrypt se začaly ozývat hlasy, které se ptají, zda „certifikát zdarma pro všechny“ znamená i pro všechny phishingové a malware weby. Znamená to, že certifikát už není zárukou kvality a autorita ho vydá komukoliv, kdo si řekne? Bez ohledu na jeho úmysly a obsah jeho webu?